列兵、上等兵、士官都不是军官，但士官是军官的储备，如果建立军功，或者考核为优秀，或者因扩军需要，可以晋升为少尉。
这是对大明军队制度的一次巨大变革，以前的大明，士兵永远是士兵，即使立了战功，或者有优异的表现，也永远是士兵，绝对不能晋升为军官，最多获得一些物质上的奖励。
实行士官制度，给基层的士兵打开了一扇晋升的大门，尽管这扇大门现在只是开启了一条隙缝，士兵毕竟有了希望。
军官的军衔为三段十级。
副排长：少尉，肩章为一杠一星；排长：中尉，肩章为一杠两星；副连长、连长：上尉，肩章为一杠三星。少尉、中尉、上尉称尉级军官。
副营长：少校，肩章为两杠一星；营长、副团长：中校，肩章为两杠两星；团长、副旅长：上校，肩章为两杠三星；旅长、副师长：大校，肩章为两杠四星。少校、中校、上校、大校称校级军官。
师长、副军长：少将，肩章为金枝一星；军长：中将，肩章为金枝两星。
另外设立上将军衔，肩章为金枝三星。上将具备指挥数个军参加战斗的权力，相当于集团军司令，在战争时期，如果需要，可临时加封为司令，指挥大型战役。
根据崇祯年间的战争状况，以及平时指挥军队的能力，第一次设立六位上将军衔，分别是第一军军长袁崇焕、第四军军长洪承畴、第十四军军长左良玉、第十九军军长沐启元、第十三军军长祖大寿、辽宁省长孙承宗。
此外，国防院提议，崇祯帝为马上皇帝，为了更好地统帅全国的兵马，加封朱由检为大元帅。
对于这样的职务，朱由本来觉得无所谓，但他考虑到，大明军人的地位肯定会提升，如果士兵将来只认识自己的将军，不认识皇帝，将军们就可能拥兵自重，设立大元帅一职，让士兵与军官随时想到，皇帝、大元帅才是军队的最高指挥官，所以也就当朝接受了国防院的加封。
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