根据朱由检的指示，所有六岁至十岁的儿童，不分男女，必须入学校学习汉语、汉话，孔子学校实行男女分班制，再根据不同的年龄，分成不同的班级，年龄相近的分在同一个班级。
赤，塔府孔子学校一共招收了四百余儿童，分成八个班，而亨九县孔子学校、北望县孔子学校都只有不到三百学生，分成六个班。
这些儿童，每年在学校学习的时间，都是八个月，其余的四个月放假，其中十二月、一月、二月因为天气太冷，放寒假，七月天气太热，放暑假。
八个月的上学时间，分为上下两个学期，三月、四月、五月、六月为上学期，八月、九月、十月、十一月为下学期。
儿童必须集中在城内上学，实行寄宿制，所有的书籍，甚至写字的毛笔、纸张都是免费的，但儿童的饭食、服装，必须由他们的父母提供，学校代为管理。
史可法认为，这些在城内学习汉话的学生，不仅能加快汉化的速度，而且儿童都住在城内，又能作为人质，可以预防他们的父母逃亡。
洪承畴是最高兴的，自从学校开学，他由原来的每天去各个村庄视察一次，改为三天视察一次。
学校的开学工作刚刚稳定，刑部流放岭北省的重刑犯就到达了，随同他们一起到达的，还有朱由检的一封亲笔信，这是他对史可法、洪承畴的回信，朱由检没有下达圣旨，而是以私人书信的形式，并且告诉史可法、洪承畴二人，看过书信之后，立即销毁，不得保留，只要领会信件的精神即可。
在信件中，朱由检告诉两人，士兵在关外，远离自己的亲人和家乡，生活又十分单调，尽量丰富他们的业余生活，比如各种比赛、娱乐等。
如果士兵思乡情切，他们必然不能安心服役，不仅军队的战斗力下降，也影响士兵为大明守土开疆的决心和主动性，毕竟他们要在关外驻守五年。
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